Los dibujos a plumilla constituyen uno de los sistemas de representación preferidos por el pintor. Que comenzó a dibujar con tintas desde su más tierna adolescencia. Su mayor aportación en este procedimiento es la serie Rincones del Alto Aragón, compuesta por 400 dibujos publicados por el Heraldo de Aragón entre 1978 y 1988. Los dibujos de Fernando Alvira han ilustrado además portadas de libros y revistas, artículos en periódicos, cartas de restaurantes o inserciones publicitarias.

A ellos hay que añadir los conocidos como Dibujos en reunión, serie que reúne más de doscientos bocetos de todo tipo, fruto de las muchas horas dedicado a cuestiones administrativas en diversos momentos de su trabajo. En menor medida ha utilizado lápices, carbones, pasteles u otros procedimientos para esta parte de su trabajo.